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딥러닝을 이용한 단백체 질량분석 데이터 해석 기반기술 개발

 

연구내용 질량분석을 통한 단백체 분석 데이터의 해석에 요구되는 기반기술을 딥러닝을 이용하여 확보하는 것을 목적으로 한다. 최근의 생물정보학 연구에서, 유전체학에 대해서는 딥러닝 기술이 활발하게 적용되고 있는 반면 단백체학에서는 이제 막 연구를 시작해 나가는 단계에 있다. 본 연구에서는 단백체 연구에 있어서 핵심 기술인 질량분석법의 데이터 분석에 딥러닝을 적용하여 효율과 효용성을 높이고자 한다.
시행기관 한국연구재단
연구기간 2017년 10월 ~ 2020년 10월

 


 

UTR의 번역 펩타이드 프로파일링에 의한 새로운 동형 단백질의 발굴

 

연구내용 기존에는 알려지지 않은 완전히 새로운 동형 단백질 (protein isoform)을 단백체 수준에서 1억여 개의 질량스펙트럼을 대상으로 대규모 데이터 분석을 통해 발굴하고 이들의 질병관련성을 살펴본다. 인포매틱스 기술을 통해 선별된 동형 단백질의 질병관련성을 검증하는 실험을 수행하여 약물의 타겟이나 조기 진단을 위한 바이오마커 후보를 제시한다.
시행기관 한국연구재단
연구기간 2014년 11월 ~ 2017년 10월

 


 

대용량 유전체 기반 프로테오믹스 정보 분석 연구

 

연구내용 Hadoop을 이용한 Exon Graph spectrum 검색 분산 알고리즘 개발
시행기관 한국생명공학연구원
연구기간 2013년 6월 ~ 2013년 12월

 


 

실무형 유전체/단백체 정보분석 교육프로그램 개발과 운영

 

연구내용 유전체/단백체 정보분석 및 알고리즘의 원리를 이해하고 실제 문제에 적용할 수 있도록 하는 교육프로그램을 개발한다.
시행기관 유전체미래원천기술개발시범사업
연구기간 2012년 11월 ~ 2017년 11월

 


 

차세대시퀀싱 기반 프로테옴 데이터 해석을 위한 소프트웨어 기술

 

연구내용 개인별 NGS 결과를 기반으로 발현된 유전체 정보를 획득하고, 이를 대상으로 단백체 데이터의 해석을 수행함으로써 개인별로 차별화된 단백체 분석이 가능하며, 이 과정에서 유전체와 단백체 정보를 통합분석함으로써 한차원 높은 수준의 개인별 바이오 정보를 획득한다.
시행기관 교육과학기술부 다중오믹스신기술개발사업
연구기간 2012년 6월 ~ 2017년 5월

 


 

ARS 단백체의 수식화 프로파일을 위한 질량분석 데이터 해석

 

연구내용  
시행기관 교육과학기술부 글로벌프론티어연구개발사업
연구기간 2011년 8월 ~ 2012년 8월

 


 

포괄적인 프로테옴 수식화 해석을 위한 핵심알고리즘 개발 및 데이터베이스 구축

 

연구내용  
시행기관 교육과학기술부 21세기 프론티어 연구사업
연구기간 2008년 4월 ~ 2012년 3월

 


 

세포신호전달계 바이오의약 Target Validation 및 효능물질 설계

 

연구내용 세포신호전달과 관련된 질병의 표적 단백질에 대한 다양한 정보를 토대로 하여 지식기반 활성물질의 탐색 및 설계. Pathway와 sequence 분석을 위한 알고리즘 개발 및 단백질의 구조 규명을 활용하는 소프트웨어적 분석 방법론 제시한다.
시행기관 과학재단 국가핵심연구센터
연구기간 2006년 6월 ~ 2013년 2월

 


 

USN/시맨틱웹 기반, 시민참여형 미래 u-Seoul 서비스 모델설계 및 기술개발

 

연구내용 USN과 관련된 서울시정의 온톨로지를 구축하고, 이를 기반으로 한 u-Seoul 응용 서비스 인터페이스를 설계함으로써 통합된 u-Seoul 서비스를 위한 기술적 기반을 마련한다.
시행기관 서울시
연구기간 2007년 12월 ~ 2012년 11월

 


 

프로테옴 수식화 분석을 위한 informatics 기술 개발

 

연구내용 단백질의 수식화는 단백질이 세포 내에서 동적으로 특정한 상태에 존재하면서 수행하는 기능을 밝히는 데 있어 매우 중요한 정보를 제공한다. 단백질의 수식화를 대량으로 분석하는 방법으로, 현재 유일한 방법은 질량분석법이다. 질량분석 데이터를 효율적으로 해석하여 단백질의 수식화를 효과적으로 동정할 수 있는 알고리즘을 개발하고 더 나아가 새로운 수식화 기제를 밝히는 근거를 제시한다.
시행기관 과학기술부 21세기 프론티어 연구사업
연구기간 2005년 4월 ~ 2008년 3월

 


 

세포신호전달체계 DB 구축 및 기반 기술 개발

 

연구내용 세포신호전달체계에 관련된 biomolecule과 이들 간의 관계를 데이터베이스화하기 위해, 세포신호전달에 관여하는 다양한 물질에 대한 데이터모델을 개발하고 이를 데이터베이스화하여 웹서비스로서 생물학자들에게 제공한다.
시행기관 정보통신부 IMT-2000 기술개발 사업
연구기간 2001년 12월 ~ 2004년 11월

   

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